После поражения архиепископа Петельгейзера Романе-Конти из Культа Ведьм наступает период затишья. Субару Нацуки, обычный парень из другого мира, оказавшийся в фэнтезийной реальности, теперь может проводить время с Эмилией и другими союзниками, обретенными в ходе конфликта.

В изолированном регионе Гэнсокё, отделённом от внешнего мира магическим барьером, проживают ёкаи, необычные животные и люди. Поддержанием баланса в этой местности занимается служительница святилища Хакурэй, Рэйму Хакурэй. В её обязанности входит расследование различных