В данной части аниме действуют несколько ключевых персонажей. Главным героем является школьник Конан Эдогава. Его сопровождает Мори Ран, занимающаяся каратэ. В их компанию входят бывший полицейский Кагоро Мори и подруга Ран, Сузуки Саноко, происходящая из состоятельной семьи.

В космическом пространстве действует пират по имени Мито, капитан звездолета, рост которой составляет около трех футов. Ее имя включено в галактический список наиболее разыскиваемых преступников. Мито демонстрирует высокую эффективность в противостоянии с силами правопорядка,